Η Μονή βρίσκεται στο μέσο του Αγιονησίου, ενός μικρού πευκόφυτου νησιού στην είσοδο του κόλπου της Ηγουμενίτσας. Η εποχή της ιδρύσεώς της είναι άγνωστη, γνωρίζουμε όμως από παλιούς βενετικούς χάρτες, όπου όλο το νησί ονομάζεται «Βραχονησίδα της Παναγίας», ότι χρονολογείται τουλάχιστον από το 1654. Η ιστορία της Μονής δεν είναι γνωστή, όμως εύκολα μπορούμε να υποθέσουμε, ότι λόγω της ευαίσθητης θέσης του νησιού, έχει λεηλατηθεί και καταστραφεί σε παλαιότερη εποχή. Σώζεται το μικρό μονόχωρο Καθολικό, που είναι πρόσφατα ανακαινισμένο, καθώς επίσης κάποια ερείπια των κελλιών και ένα πηγάδι. Εορτάζει την ημέρα της Ζωοδόχου Πηγής, κάθε Παρασκευή της Διακαινησίμου, οπότε υπάρχει δυνατότητα πρόσβασης από τη θάλασσα με σκάφος, που εκτελεί δρομολόγια από την Ηγουμενίτσα μέχρι το νησί.